Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NinlQ6ZQ12 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NinlQ6ZQ12 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NinlQ6ZQ12 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NinlQ6ZQ12 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
NinlQ6ZQ12 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NinlQ6ZQ12 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
NinlQ6ZQ12 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms