Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ06

Cep162, Centrosomal protein of 162 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep162Q6ZQ06 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cep162Q6ZQ06 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cep162Q6ZQ06 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Cep162Q6ZQ06 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Cep162Q6ZQ06 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Cep162Q6ZQ06 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cep162Q6ZQ06 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cep162Q6ZQ06 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cep162Q6ZQ06 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Cep162Q6ZQ06 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cep162Q6ZQ06 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cep162Q6ZQ06 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Cep162Q6ZQ06 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Cep162Q6ZQ06 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Cep162Q6ZQ06 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cep162Q6ZQ06 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cep162Q6ZQ06 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Cep162Q6ZQ06 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cep162Q6ZQ06 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cep162Q6ZQ06 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cep162Q6ZQ06 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
Cep162Q6ZQ06 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms