Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc44a1Q6X893 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc44a1Q6X893 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc44a1Q6X893 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc44a1Q6X893 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc44a1Q6X893 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc44a1Q6X893 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms