Protein–RNA interactions for Protein: Q6T3U4

Npc1l1, Niemann-Pick C1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1l1Q6T3U4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Npc1l1Q6T3U4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Npc1l1Q6T3U4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Npc1l1Q6T3U4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Npc1l1Q6T3U4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Npc1l1Q6T3U4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms