Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Krt9Q6RHW0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt9Q6RHW0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Krt9Q6RHW0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Krt9Q6RHW0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt9Q6RHW0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms