Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nudcd1Q6PIP5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nudcd1Q6PIP5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudcd1Q6PIP5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudcd1Q6PIP5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms