Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb39Q6PDK0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Zbtb39Q6PDK0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbtb39Q6PDK0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbtb39Q6PDK0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Zbtb39Q6PDK0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Zbtb39Q6PDK0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zbtb39Q6PDK0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbtb39Q6PDK0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Zbtb39Q6PDK0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zbtb39Q6PDK0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms