Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCM2

Ints6, Integrator complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ints6Q6PCM2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ints6Q6PCM2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ints6Q6PCM2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ints6Q6PCM2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ints6Q6PCM2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ints6Q6PCM2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ints6Q6PCM2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ints6Q6PCM2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ints6Q6PCM2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms