Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAL0

Bend3, BEN domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bend3Q6PAL0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bend3Q6PAL0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Bend3Q6PAL0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Bend3Q6PAL0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Bend3Q6PAL0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Bend3Q6PAL0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Bend3Q6PAL0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Bend3Q6PAL0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms