Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Q4

Fhod1, FH1/FH2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhod1Q6P9Q4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fhod1Q6P9Q4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Fhod1Q6P9Q4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fhod1Q6P9Q4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Fhod1Q6P9Q4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fhod1Q6P9Q4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Fhod1Q6P9Q4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms