Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc148Q6P5U8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc148Q6P5U8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc148Q6P5U8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc148Q6P5U8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc148Q6P5U8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc148Q6P5U8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc148Q6P5U8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc148Q6P5U8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc148Q6P5U8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc148Q6P5U8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc148Q6P5U8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc148Q6P5U8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc148Q6P5U8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc148Q6P5U8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc148Q6P5U8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms