Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac10Q6P3E7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac10Q6P3E7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac10Q6P3E7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hdac10Q6P3E7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hdac10Q6P3E7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms