Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppp4r3aQ6P2K6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ppp4r3aQ6P2K6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ppp4r3aQ6P2K6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ppp4r3aQ6P2K6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppp4r3aQ6P2K6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ppp4r3aQ6P2K6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp4r3aQ6P2K6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppp4r3aQ6P2K6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp4r3aQ6P2K6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp4r3aQ6P2K6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppp4r3aQ6P2K6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp4r3aQ6P2K6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppp4r3aQ6P2K6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp4r3aQ6P2K6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppp4r3aQ6P2K6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 428.1 ms