Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Rad17Q6NXW6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rad17Q6NXW6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rad17Q6NXW6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rad17Q6NXW6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rad17Q6NXW6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rad17Q6NXW6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rad17Q6NXW6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rad17Q6NXW6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rad17Q6NXW6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rad17Q6NXW6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rad17Q6NXW6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rad17Q6NXW6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rad17Q6NXW6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rad17Q6NXW6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rad17Q6NXW6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Rad17Q6NXW6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Rad17Q6NXW6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rad17Q6NXW6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rad17Q6NXW6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rad17Q6NXW6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rad17Q6NXW6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rad17Q6NXW6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms