Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rprd2Q6NXI6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rprd2Q6NXI6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rprd2Q6NXI6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rprd2Q6NXI6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rprd2Q6NXI6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rprd2Q6NXI6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rprd2Q6NXI6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Rprd2Q6NXI6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rprd2Q6NXI6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rprd2Q6NXI6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rprd2Q6NXI6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Rprd2Q6NXI6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rprd2Q6NXI6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rprd2Q6NXI6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rprd2Q6NXI6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rprd2Q6NXI6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Rprd2Q6NXI6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 877.6 ms