Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Fndc3bQ6NWW9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fndc3bQ6NWW9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fndc3bQ6NWW9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fndc3bQ6NWW9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fndc3bQ6NWW9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms