Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bfsp2Q6NVD9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bfsp2Q6NVD9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bfsp2Q6NVD9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Bfsp2Q6NVD9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms