Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTA4

Rragb, Ras-related GTP-binding protein B, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RragbQ6NTA4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RragbQ6NTA4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RragbQ6NTA4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RragbQ6NTA4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RragbQ6NTA4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RragbQ6NTA4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms