Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
SphkapQ6NSW3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SphkapQ6NSW3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SphkapQ6NSW3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SphkapQ6NSW3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SphkapQ6NSW3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SphkapQ6NSW3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SphkapQ6NSW3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SphkapQ6NSW3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SphkapQ6NSW3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
SphkapQ6NSW3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SphkapQ6NSW3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SphkapQ6NSW3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SphkapQ6NSW3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SphkapQ6NSW3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SphkapQ6NSW3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SphkapQ6NSW3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SphkapQ6NSW3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SphkapQ6NSW3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms