Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
B4galnt3Q6L8S8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
B4galnt3Q6L8S8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
B4galnt3Q6L8S8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
B4galnt3Q6L8S8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4galnt3Q6L8S8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
B4galnt3Q6L8S8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms