Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mvb12bQ6KAU4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mvb12bQ6KAU4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mvb12bQ6KAU4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mvb12bQ6KAU4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mvb12bQ6KAU4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mvb12bQ6KAU4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms