Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt77Q6IFZ6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt77Q6IFZ6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt77Q6IFZ6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt77Q6IFZ6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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