Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Otud6aQ6IE21 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otud6aQ6IE21 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otud6aQ6IE21 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otud6aQ6IE21 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms