Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PnkdQ69ZP3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PnkdQ69ZP3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PnkdQ69ZP3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PnkdQ69ZP3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PnkdQ69ZP3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PnkdQ69ZP3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PnkdQ69ZP3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PnkdQ69ZP3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PnkdQ69ZP3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PnkdQ69ZP3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnkdQ69ZP3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PnkdQ69ZP3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.1 ms