Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jmjd1cQ69ZK6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Jmjd1cQ69ZK6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Jmjd1cQ69ZK6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Jmjd1cQ69ZK6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Jmjd1cQ69ZK6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd1cQ69ZK6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd1cQ69ZK6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd1cQ69ZK6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jmjd1cQ69ZK6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Jmjd1cQ69ZK6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Jmjd1cQ69ZK6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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