Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Zcchc2Q69ZB8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zcchc2Q69ZB8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zcchc2Q69ZB8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zcchc2Q69ZB8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Zcchc2Q69ZB8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc2Q69ZB8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Zcchc2Q69ZB8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zcchc2Q69ZB8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Zcchc2Q69ZB8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Zcchc2Q69ZB8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Zcchc2Q69ZB8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Zcchc2Q69ZB8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Zcchc2Q69ZB8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Zcchc2Q69ZB8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zcchc2Q69ZB8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zcchc2Q69ZB8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Zcchc2Q69ZB8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc2Q69ZB8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Zcchc2Q69ZB8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms