Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Atg9aQ68FE2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg9aQ68FE2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg9aQ68FE2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg9aQ68FE2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Atg9aQ68FE2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Atg9aQ68FE2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atg9aQ68FE2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atg9aQ68FE2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atg9aQ68FE2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Atg9aQ68FE2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Atg9aQ68FE2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atg9aQ68FE2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Atg9aQ68FE2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg9aQ68FE2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg9aQ68FE2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 750.6 ms