Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CilpQ66K08 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CilpQ66K08 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CilpQ66K08 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CilpQ66K08 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CilpQ66K08 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms