Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ctnna3Q65CL1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ctnna3Q65CL1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ctnna3Q65CL1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ctnna3Q65CL1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ctnna3Q65CL1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178 ms