Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ly6eQ64253 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Ly6eQ64253 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly6eQ64253 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly6eQ64253 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.1 ms