Protein–RNA interactions for Protein: Q64221

Nhlh2, Helix-loop-helix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh2Q64221 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh2Q64221 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nhlh2Q64221 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh2Q64221 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh2Q64221 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nhlh2Q64221 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh2Q64221 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh2Q64221 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh2Q64221 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nhlh2Q64221 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh2Q64221 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nhlh2Q64221 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nhlh2Q64221 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nhlh2Q64221 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nhlh2Q64221 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nhlh2Q64221 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms