Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CochQ62507 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CochQ62507 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CochQ62507 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CochQ62507 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CochQ62507 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CochQ62507 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CochQ62507 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CochQ62507 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CochQ62507 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CochQ62507 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CochQ62507 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CochQ62507 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CochQ62507 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CochQ62507 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CochQ62507 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CochQ62507 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CochQ62507 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CochQ62507 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CochQ62507 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CochQ62507 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CochQ62507 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CochQ62507 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CochQ62507 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CochQ62507 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CochQ62507 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CochQ62507 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CochQ62507 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CochQ62507 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CochQ62507 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CochQ62507 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CochQ62507 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CochQ62507 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CochQ62507 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CochQ62507 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CochQ62507 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CochQ62507 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CochQ62507 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CochQ62507 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CochQ62507 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CochQ62507 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CochQ62507 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CochQ62507 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CochQ62507 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CochQ62507 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CochQ62507 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CochQ62507 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CochQ62507 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CochQ62507 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CochQ62507 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CochQ62507 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CochQ62507 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CochQ62507 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CochQ62507 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CochQ62507 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CochQ62507 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CochQ62507 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CochQ62507 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CochQ62507 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CochQ62507 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CochQ62507 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CochQ62507 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CochQ62507 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CochQ62507 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CochQ62507 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CochQ62507 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CochQ62507 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CochQ62507 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CochQ62507 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CochQ62507 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CochQ62507 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CochQ62507 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CochQ62507 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CochQ62507 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CochQ62507 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CochQ62507 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CochQ62507 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CochQ62507 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CochQ62507 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CochQ62507 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CochQ62507 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CochQ62507 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CochQ62507 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CochQ62507 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CochQ62507 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CochQ62507 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CochQ62507 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CochQ62507 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CochQ62507 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CochQ62507 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CochQ62507 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CochQ62507 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CochQ62507 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CochQ62507 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CochQ62507 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CochQ62507 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CochQ62507 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CochQ62507 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CochQ62507 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CochQ62507 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms