Protein–RNA interactions for Protein: Q62432

Smad2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad2Q62432 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smad2Q62432 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smad2Q62432 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad2Q62432 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smad2Q62432 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smad2Q62432 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms