Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ss18Q62280 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ss18Q62280 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ss18Q62280 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ss18Q62280 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ss18Q62280 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ss18Q62280 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ss18Q62280 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ss18Q62280 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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