Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcbp2Q61990 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcbp2Q61990 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pcbp2Q61990 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcbp2Q61990 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcbp2Q61990 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms