Protein–RNA interactions for Protein: Q61805

Lbp, Lipopolysaccharide-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbpQ61805 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LbpQ61805 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LbpQ61805 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LbpQ61805 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LbpQ61805 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LbpQ61805 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LbpQ61805 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LbpQ61805 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LbpQ61805 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LbpQ61805 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LbpQ61805 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LbpQ61805 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LbpQ61805 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LbpQ61805 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LbpQ61805 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LbpQ61805 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LbpQ61805 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LbpQ61805 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LbpQ61805 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms