Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itga7Q61738 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Itga7Q61738 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Itga7Q61738 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Itga7Q61738 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga7Q61738 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Itga7Q61738 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga7Q61738 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga7Q61738 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga7Q61738 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Itga7Q61738 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1033.7 ms