Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gli3Q61602 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Gli3Q61602 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Gli3Q61602 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Gli3Q61602 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gli3Q61602 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gli3Q61602 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Gli3Q61602 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Gli3Q61602 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gli3Q61602 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Gli3Q61602 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Gli3Q61602 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gli3Q61602 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gli3Q61602 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Gli3Q61602 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Gli3Q61602 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Gli3Q61602 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Gli3Q61602 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gli3Q61602 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gli3Q61602 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gli3Q61602 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Gli3Q61602 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Gli3Q61602 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gli3Q61602 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gli3Q61602 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gli3Q61602 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Gli3Q61602 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Gli3Q61602 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gli3Q61602 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Gli3Q61602 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Gli3Q61602 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Gli3Q61602 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Gli3Q61602 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Gli3Q61602 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gli3Q61602 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Gli3Q61602 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Gli3Q61602 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Gli3Q61602 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Gli3Q61602 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Gli3Q61602 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Gli3Q61602 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms