Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rbbp7Q60973 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rbbp7Q60973 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rbbp7Q60973 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rbbp7Q60973 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbbp7Q60973 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms