Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Meis1Q60954 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Meis1Q60954 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Meis1Q60954 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Meis1Q60954 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Meis1Q60954 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms