Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vdac3Q60931 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vdac3Q60931 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vdac3Q60931 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vdac3Q60931 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vdac3Q60931 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms