Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnot7Q60809 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cnot7Q60809 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Cnot7Q60809 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnot7Q60809 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnot7Q60809 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cnot7Q60809 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnot7Q60809 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnot7Q60809 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms