Protein–RNA interactions for Protein: Q60662

Akap4, A-kinase anchor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap4Q60662 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Akap4Q60662 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Akap4Q60662 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Akap4Q60662 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Akap4Q60662 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Akap4Q60662 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Akap4Q60662 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Akap4Q60662 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Akap4Q60662 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Akap4Q60662 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Akap4Q60662 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Akap4Q60662 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Akap4Q60662 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Akap4Q60662 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Akap4Q60662 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Akap4Q60662 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Akap4Q60662 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Akap4Q60662 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Akap4Q60662 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms