Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFR0

Pabpn1l, Embryonic polyadenylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpn1lQ5XFR0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pabpn1lQ5XFR0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pabpn1lQ5XFR0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pabpn1lQ5XFR0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pabpn1lQ5XFR0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpn1lQ5XFR0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpn1lQ5XFR0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpn1lQ5XFR0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpn1lQ5XFR0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pabpn1lQ5XFR0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms