Protein–RNA interactions for Protein: Q5UKY4

Cd200r3, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r3Q5UKY4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cd200r3Q5UKY4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd200r3Q5UKY4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd200r3Q5UKY4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd200r3Q5UKY4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd200r3Q5UKY4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd200r3Q5UKY4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd200r3Q5UKY4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd200r3Q5UKY4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd200r3Q5UKY4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd200r3Q5UKY4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd200r3Q5UKY4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd200r3Q5UKY4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms