Protein–RNA interactions for Protein: Q5U452

Trp53rka, MCG14616, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53rkaQ5U452 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trp53rkaQ5U452 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Trp53rkaQ5U452 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trp53rkaQ5U452 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trp53rkaQ5U452 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53rkaQ5U452 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53rkaQ5U452 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trp53rkaQ5U452 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms