Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mks1Q5SW45 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mks1Q5SW45 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mks1Q5SW45 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mks1Q5SW45 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms