Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cyfip2Q5SQX6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cyfip2Q5SQX6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cyfip2Q5SQX6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cyfip2Q5SQX6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cyfip2Q5SQX6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms