Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ttf2Q5NC05 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ttf2Q5NC05 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ttf2Q5NC05 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ttf2Q5NC05 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ttf2Q5NC05 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms