Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynaQ5G5D5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SynaQ5G5D5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SynaQ5G5D5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SynaQ5G5D5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SynaQ5G5D5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SynaQ5G5D5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms